林奇的投资指导思想基本是以价值为中心的，当然，他在企业的价值量化评估的基础上更看中非量化的内在价值，比如企业的新产品推出市场，企业的管理工作进一步加强等都是促使企业价值提升的因素，林奇往往利用各種方式发现这些亮点，并及时投入。
另外，对于股票的投资价值，林奇有自己的另一个独特看法，他认为一支股票的投资价值完全取决于评估的时间点。在美國股市历史上，曾经有过许多类型的股票红极一时，象铁路股、航空股以及以后的家电股等。但是，随着时间的推移，科技的进步使得这些股票最终光芒尽失。
许多投资者不知道自己为什么买股票，认为股价涨了表明股票有投资价值，而不去充分了解企业的基本面情况，一旦股价下跌，他会对企业失去信心，从而卖出股票。实际上，股价的波动常会出现从众的情形，很多优质的股票在大盘走软时股价也会随着回落，此时，显然是买进这些股票的好时机。
林奇始终认为，依靠图表而不是对公司进行深入调查研究来进行投资决策无异于盲人摸象，这样做不但难于获得可观的利润，还容易错失获大利的机会。
报表是上市公司在一定时段内经营情况的总结，也是公司财务状况对外披露的途径。可以说，财务报表是投资者了解企业的一个窗口，而基本面情况会透露出企业的未来价值。1994年，林奇发现强生公司的股价在一路下跌，但是翻看其财务报表，各项指标都相当不错，公司的利润增长已经持续了30多年，且公司过去对利润的预期也很少出现偏差。由于股价的下跌，技术派的投资者纷纷卖出股票。而林奇却发现，股价下跌的症结在于政府可能出台一项政策，这项政策可能会对公司产生影响，但实际上影响并不一定如想象中那么大，于是他果断买进了该股票，并取得了相当好的收益。
林奇在阅读报表时比较注重的指标有：销售比例、价益比、现金状况、负债率、帐面资产、股息、现金流量、存货、净资产收益率等。
在麦哲伦基金时，林奇每年要走访三十多家公司，每次走访的大致内容他都记录在一个本子上，并成为他买卖股票的最基本依据。在麦哲伦基金投资扩大到國外时，林奇曾到欧洲进行一段投资之旅，通过与上市公司的交流，林奇成功地捕捉到沃尔沃等大牛股，当年该股的收益达到麦哲伦基金总收益的一半左右，一时成为佳话。
除了直接到上市公司走访外，林奇还和许多行业内的专家保持了相当紧密的联系，这样他对行业的动态基本能够做到了如指掌，他常购买行业内的大部分受益个股正是这个道理。另外，麦哲伦基金为了能和外界更好地交流，组织了午餐会与上市公司的管理人员交流，后来还增加了早餐和晚餐会，靠着这，麦哲伦基金获得了大量的有用信息，也大大提高了基金选股的准确性。
从麦哲伦基金当年公布的1400多種的持股来看，大致有以下几種类型：①成长股，林奇对这些股票期望的收益是200%-300%；②价值型股票，这些股票的价格接近或低于企业帐面净值，在买入后股价上涨了三贩N唬制婢突峥悸前阉浅鍪郑虎奂ㄓ殴桑渲写蟛糠治檬乱怠⑹称返壤嘈偷墓善保饫喙善蹦芙虾玫氐钟玫木捌罚虎茉偕桑捎谡饫喙善泵媪倬鹊淖郏钟邢嗟贝蟮牟蝗范ㄐ裕虼朔缦站薮螅牵坏┳统晒Γ笠步浅７岷瘛�
林奇认为，寻找优质的股票就象是沙里淘金一样，需要做大量的淘洗，十次中能够有一次收获，一百次就会有十次的收获。选股也是如此，需要做大量的准备工作，经过不断的筛选，最后获得少量的投资品種。而暂时不投资的股票可以作为储备，并作长期的跟踪。
林奇认为，最佳的投资对象大都不是来自分析家的报告，而是来自日常生活。在日常生活中，对于新产品的接触是最直接的，对于公司的服务的感受也是最直接的，因此投资者对企业的体认也是最直接的，此时那些有潜质的公司往往还没有大资金关注时，价格相当吸引人，而一旦分析家们关注这个股票时，股价早已经涨得很高了。林奇曾买过一支汽车旅馆股票，当时他在该旅馆中住宿，旅馆的优质服务吸引了他，后来该股票大涨。
林奇最感兴趣的是那種“闷死人型”的股票（dullcompanies），这些公司中有些不喜欢进行大肆的宣传，以致于很少有人对其关注，走势也相当疲软，价格长期波澜不兴。而实际上这些公司中很多具有相当的潜力，在别人尚未关注时逐步介入，待大多数人醒悟过来时，你就可以愉快地坐轿子了。
